Um dos pilares de sua gestão, o modelo de Governança Corporativa da Mendes Júnior é composto atualmente de um Conselho de Administração, órgão máximo na estrutura, cujo papel é o de definir a orientação do negócio e o planejamento estratégico, e de um Colegiado Diretivo, integrado pela Diretoria Executiva, que tem a função de otimizar a tomada de decisão e o desenvolvimento dos negócios.